MEDIODES tiene sus oficinas centrales en Málaga, junto al campus universitario de Teatinos. Cuenta con cuatro vehículos, incluyendo vehículos todoterreno.

El equipamiento informático está compuesto por ordenadores de sobremesa y portátiles, y un equipo servidor; así como por un plotter HP, y diversas impresoras y multifuncionales. Tiene asimismo dominio propio de correo, web y servidor FTP.

Dispone de cámara de fotos réflex digital, analógica y compacta, y escáner de diapositivas Nikon.

Junto al software de ofimática, estadística, diseño gráfico, CAD y SIG, dispone de una base de datos propia con ortofotografías y cartografía en formato SIG y CAD, procedente de diversas administraciones y universidades, así como desarrollada en la misma empresa.

De igual modo, MEDIODES posee una biblioteca con más de 500 títulos sobre Medio Ambiente y una hemeroteca con 49 títulos de revistas nacionales e internacionales y 350 números.

Para el equipo de campo dispone de GPS Garmin, equipo de pesca eléctrica, correntímetro OTT de precisión para caudales bajos, instrumental de análisis físico-químico portátil y redes para muestreo de peces y otra fauna acuática: trasmallos, nasas holandesas y minnow traps.

Las instalaciones de MEDIODES incluyen un laboratorio equipado con lupas binoculares, microscopios, espectrofotómetros y otros medios para realizar análisis físico-químicos de las aguas, composición de suelos, etcétera.